2016년 10월 28일 금요일

NCBI 데이터 다운로드

1. Aspera
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/public/

download aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz

isbyeon$ tar zxvfp aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz 
aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh

isbyeon$ sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh

isbyeon$ vi ~/.bash_profile
PATH=$PATH:$HOME/bin:/home/isbyeon/.aspera/connect/bin

isbyeon$ source ~/.bash_profile

isbyeon$ ascp -k 1 -T -l300m -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/refseq/release/archaea ./archaea


2. rsync
isbyeon$ rsync -av ftp.ncbi.nlm.nih.gov::refseq/release/archaea ./archaea

댓글 없음:

댓글 쓰기